Территория Вологодской и Костромской областей, а также части Ярославской и Кировской областей обслуживается Вологодским территориальным управлением СЖД. Развернутая длина главных путей — около 2 тысяч километров, все они электрифицированы. На станциях Вологодского региона осуществляется около трети всей погрузки СЖД, в основном это черные металлы, минеральные удобрения и стройматериалы. Здесь расположены крупнейшие промышленные предприятия Северо-Запада России — металлургический гигант ПАО «Северсталь» и лидер по производству удобрений АО «Апатит».

Через регион проходят основные грузопотоки страны в направлениях «север – юг» и «восток – запад». Для увеличения его пропускной способности идет постоянное развитие Вологодского и Череповецкого железнодорожных узлов, крупнейшей сортировочной станции Лоста, станций Буй, Шарья и других. В 2020 году открыто движение по третьему главному пути на участке Вологда-I — Вологда-II.